1材料和方法
1.1材料與裝置
宿主藻:席藻(Phormidium sp.)為本課題組2009年在武漢分離得到[20]。噬藻體:噬藻體PP為本課題組2001年在武漢分離得到[26]。
自制SECT培養(yǎng)箱:培養(yǎng)箱的溫控系統(tǒng)由溫度控制器、風(fēng)扇、加熱器等組成,實(shí)測(cè)箱內(nèi)溫度波動(dòng)范圍為±0.2℃。CO2濃度控制系統(tǒng)由CO2鋼瓶、緩沖箱、CO2控制器、電磁閥、氣泵、減壓閥等構(gòu)成,其中CO2鋼瓶中的高濃度CO2先經(jīng)減壓閥和電磁閥輸入至緩沖箱(一級(jí)CO2控制器通過(guò)控制電磁閥啟閉使緩沖箱內(nèi)的pCO2濃度為(2000±200)ppm),緩沖箱內(nèi)的氣體再經(jīng)微型氣泵輸入至SECT培養(yǎng)箱(二級(jí)CO2控制器通過(guò)控制微型氣泵的啟閉使SECT培養(yǎng)箱內(nèi)的pCO2濃度的波動(dòng)幅度達(dá)到±50 ppm)。
1.2宿主藻的培養(yǎng)
用AA液體培養(yǎng)基[35]培養(yǎng)席藻,光暗比為14 h∶10 h,光強(qiáng)為2000 lx。為更好地模擬全球氣候變化過(guò)程中大氣二氧化碳濃度升高的實(shí)際過(guò)程,采用頂空法控制pCO2濃度(而非直接將CO2通入培養(yǎng)液中)。SECT分組為:CK組,25℃+400 ppm;RCP4.5,27.4℃+538 ppm;RCP6.0,28.0℃+670 ppm;RCP8.5,29.8℃+936 ppm。其中,RCP4.5和RCP6.0代表中等強(qiáng)度的溫室效應(yīng)氣體排放,而RCP8.5代表高強(qiáng)度的溫室效應(yīng)氣體排放[1]。
為使席藻充分適應(yīng)上述溫度和二氧化碳條件,先使該藻在上述條件下傳代培養(yǎng)10個(gè)月后,再將其藻細(xì)胞密度稀釋至2.0×106 cells/mL,繼續(xù)在相應(yīng)SECT條件下培養(yǎng),每天采用顯微鏡直接計(jì)數(shù)法測(cè)定藻細(xì)胞密度,并取對(duì)數(shù)期藻用于后續(xù)試驗(yàn)。
1.3噬藻體PP對(duì)宿主藻的吸附率的測(cè)定
由于隨著RCP等級(jí)的逐步提高(主要是由于二氧化碳濃度的逐步升高),對(duì)數(shù)期藻液的pH比對(duì)照組分別下降了0.05,0.10和0.25,為了使稀釋后的藻液仍保留此pH差異,取對(duì)數(shù)期藻液用0.02μm濾膜過(guò)濾收集濾液,再用濾液稀釋相應(yīng)的對(duì)數(shù)期藻液,使其初始藻細(xì)胞密度達(dá)到1.0×107 cells/mL。將效價(jià)(即具有增殖能力的病毒的濃度[36])為1.0×108 PFU/mL的噬藻體PP,按照MOI(multiplication of infectivity,即噬藻體效價(jià)與宿主細(xì)胞濃度的比例[36])為1∶104的比例加入稀釋后的藻液中,充分混勻后置于相應(yīng)SECT條件下培養(yǎng),分別在0、15、30、45和60 min時(shí)取1 mL于12000×g離心5 min,采用96孔板法(8平行4梯度)測(cè)上清中的效價(jià)[36]。將0 min的效價(jià)記為P0,其它時(shí)間點(diǎn)的效價(jià)記為Pi,吸附率=(P0-Pi)/P0×100%[36]。
1.4裂解曲線和一步生長(zhǎng)曲線的測(cè)定
用1.3中的方法將對(duì)數(shù)期藻液的細(xì)胞密度稀釋至1.0×107 cells/mL。加入初始效價(jià)為1.0×108 PFU/mL的噬藻體PP,使MOI為1∶1,混勻后放在對(duì)應(yīng)SECT條件下靜置吸附30 min。再將混合液于18000×g離心10 min,用相應(yīng)的濾過(guò)液對(duì)沉淀洗滌3次(以徹底去除未吸附的噬藻體PP)。再將樣品分為a、b兩組,a組用于顯微鏡檢計(jì)藻細(xì)胞數(shù),b組則用上述濾過(guò)液梯度稀釋100倍和10000倍。將a、b樣品放在對(duì)應(yīng)SECT條件的搖床上100轉(zhuǎn)/min振蕩培養(yǎng)(用于防止已釋放的子代噬藻體PP吸附到臨近的藻絲上),并分別在0、60、90、120、150、180、210、240、270和300 min時(shí)從a組中取樣鏡檢測(cè)量藻細(xì)胞數(shù)并據(jù)此繪制藻細(xì)胞的裂解曲線,同時(shí)從b組中取樣用96孔板法測(cè)量噬藻體PP的效價(jià),各時(shí)間點(diǎn)的噬藻體釋放量=Pi/Ai(其中Ai為被裂解的藻細(xì)胞數(shù)=初始藻細(xì)胞數(shù)-該時(shí)刻的剩余藻細(xì)胞數(shù),Pi為噬藻體效價(jià)的增加量=該時(shí)刻的噬藻體效價(jià)-初始噬藻體效價(jià)[36]),并據(jù)此繪制噬藻體PP的一步生長(zhǎng)曲線。
1.5紫外損傷噬藻體的光修復(fù)率的測(cè)定
將噬藻體PP裂解液(其效價(jià)計(jì)為“原始效價(jià)”)置于12μW/cm2的UV-B燈下照射30 min進(jìn)行紫外損傷處理后,取0.1 mL紫外損傷的噬藻體PP分別在白光和紅光條件下采用空斑法測(cè)定其效價(jià)。由于紫外損傷的噬藻體能夠在白光(主要是波長(zhǎng)為300~500 nm的光)條件下被宿主光修復(fù),而在波長(zhǎng)大于620 nm的紅光條件下則不會(huì)發(fā)生光修復(fù),故紫外損傷噬藻體的光修復(fù)率可通過(guò)以下公式計(jì)算得到[19]:
光修復(fù)率%=白光條件下的效價(jià)一紅光條件下的效價(jià)原始效價(jià)-紅光條件下的效價(jià)
(1)
1.6藻細(xì)胞密度的測(cè)定
先將隨機(jī)測(cè)量的20條藻絲總長(zhǎng)度除以這20條藻絲的總細(xì)胞數(shù),即得到每個(gè)藻細(xì)胞的平均長(zhǎng)度,再將20~50個(gè)血球計(jì)數(shù)板計(jì)數(shù)室(每個(gè)計(jì)數(shù)室的體積為0.1 mm3)內(nèi)的藻絲總長(zhǎng)度除以每個(gè)藻細(xì)胞的平均長(zhǎng)度即得到這20~50個(gè)計(jì)數(shù)室內(nèi)的藻細(xì)胞數(shù),并據(jù)此計(jì)算藻細(xì)胞密度。
1.7統(tǒng)計(jì)分析
上述試驗(yàn)均設(shè)3個(gè)平行,作圖采用Graphpad Prism 5完成(圖表中的誤差量均用±SD表示);數(shù)據(jù)分析采用SPSS 10.0完成,其中吸附率曲線采用單變量一般線性模型分析,宿主藻生物量、噬藻體平均釋放量和紫外損傷修復(fù)率采用單因素方差分析,多重比較采用最小顯著性差異法(least significant difference,LSD)法。
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