土壤有益細(xì)菌可以通過組裝接觸依賴性殺傷武器(如IVA型分泌系統(tǒng)type IVA secretion system,T4ASS)有效抑制細(xì)菌病原體。目前尚不清楚這些抗菌武器是否參與土壤中的生物營養(yǎng)微生物相互作用。本文表明,在瓊脂平板上共培養(yǎng)模擬細(xì)胞間接觸的過程中,土壤細(xì)菌溶桿菌屬Lysobacter通過T4ASS觸發(fā)了假單胞菌Pseudomonas產(chǎn)生抗真菌抗生素2,4-DAPG。我們證明了假單胞菌的2,4-DAPG產(chǎn)生是通過檢測溶桿菌轉(zhuǎn)移的T4ASS效應(yīng)蛋白Le1519來實現(xiàn)的。我們將Le1519定義為LtaE(Lysobacter T4E triggering antifungal effects,Lysobacter T4E觸發(fā)抗真菌效應(yīng)),它能特異性地刺激假單胞菌中2,4-DAPG生物合成基因的表達(dá),從而保護大豆幼苗免受真菌立枯絲核菌的感染。我們進(jìn)一步發(fā)現(xiàn),LtaE可以直接結(jié)合2,4-DAPG生物合成的特異性途徑轉(zhuǎn)錄抑制因子PhlF,從而激活2,4-DAPG的生產(chǎn)。我們的研究結(jié)果突出了微生物種間和跨界互動的新模式,為擴展土壤微生物相互作用的多樣性提供了一個獨特的案例。


土壤細(xì)菌通過各種相互作用彼此交流、競爭、共存或合作,其中一些依賴于細(xì)胞間接觸,具有重要的生態(tài)意義。最近的研究表明,植物促生根際細(xì)菌(PGPR)作為土壤有益細(xì)菌,通過細(xì)胞間接觸組裝“短程”武器保持競爭力,例如VI型分泌系統(tǒng)(T6SS)。T6SS在細(xì)胞間接觸過程中注入裝有毒素的內(nèi)管,刺穿獵物細(xì)胞的細(xì)胞壁和膜。革蘭氏陽性芽孢桿菌屬不攜帶T6SS,但擁有類似于VII型分泌系統(tǒng)(T7SS)的Esx系統(tǒng),可通過接觸殺死競爭細(xì)菌。

此外,IV型分泌系統(tǒng)(T4SS)也是重要的接觸性武器,可大致分為兩類:T4ASS和T4BSS。T4ASS用于DNA傳遞和蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)運,功能包括質(zhì)粒接合、細(xì)菌間競爭和分泌毒力因子,以農(nóng)桿菌Agrobacterium tumefaciens的VirB/D4系統(tǒng)為代表;T4BSS以Dot/Icm系統(tǒng)為代表,主要由如嗜肺軍團菌Legionella pneumophila等胞內(nèi)病原體用來將效應(yīng)蛋白注入真核宿主。我們之前發(fā)現(xiàn)土壤抗真菌細(xì)菌產(chǎn)酶溶桿菌(Lysobacter enzymogenes)也使用T4ASS來殺死土生細(xì)菌病原體軟腐果膠桿菌(Pectobacterium carotovorum),并通過細(xì)胞間接觸抑制假單胞菌的生長,從而削弱其抗真菌活性。


自從發(fā)現(xiàn)T4ASS是一種殺滅細(xì)菌的裝置以來,它的功能在很大程度上被認(rèn)為是細(xì)菌種間相互作用中的抗菌劑。這種觀點是否適用于所有情況?我們有興趣了解裝有T4ASS的土壤細(xì)菌能否與其生態(tài)相關(guān)微生物建立"合作"互動關(guān)系,這是微生物互動關(guān)系中一個重要但研究較少的領(lǐng)域。為了驗證這一假設(shè),我們選擇了實驗室可用的產(chǎn)酶溶桿菌OH11和假單胞菌蛋白原Pf-5作為模式菌株。


在這項研究中,我們展示了產(chǎn)酶溶桿菌通過其T4ASS激活假單胞菌蛋白原,從而抑制鄰近真菌的生長。我們通過在PDA瓊脂平板上共培養(yǎng)這兩種細(xì)菌以模擬細(xì)胞間接觸來實現(xiàn)這一點。結(jié)果表明了假單胞菌如何通過感知溶桿菌轉(zhuǎn)運的獨特T4E來抑制真菌。因此,我們發(fā)現(xiàn)了一種新的微生物種間和跨界相互作用模式,其中一種土壤細(xì)菌與另一種建立了種間相互作用以獲得效應(yīng)蛋白,從而通過操控自身的抗真菌化合物抑制鄰近真菌的生長。我們的研究結(jié)果為擴展土壤中微生物相互作用的多樣性提供了一個獨特的案例。


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